今年六月，中国大陆的对台研究学者在北京召开闭门会议，会中邀请台湾的蓝绿学者到场，其中蓝营学者是葛永光，绿营学者是民进党秘书长林佳龙的重要幕僚、中华大学助理教授曾建元。当时，曾建元提出了绿营的“入联公投”内容，在会中并没有引起太多的反应；可是，当葛永光表达蓝营也支持入联公投时，立即引发激烈口角，中方学者表明此举将会引发很严重的台海问题。

国台办副主任孙亚夫当天晚上宴请葛永光，要求将事情的严重性带回给国民党，并要马英九审慎回应；更透过“国共平台”将中共视“入联公投”为“主权公投”、将引发两岸灾难的严重性转达给国民党主席吴伯雄、副主席关中和秘书长吴敦义。